绿色农产品开发是一项系统工程，在巩固和发展这一门专业技术中必须遵循以下基本原则。

统一完善的系统管理原则
无公害农产品开发是从生产到市场的全过程控制与管理，涉及无公害农产品的每个环节都应纳入控制与管理之中，要建章立制，有章可循，做到生产有规程，产品有标志，认证有程序，市场有监理，过程有记录，确保无公害农产品的质量控制在严格管理之中，使无公害农产品的质量要求和良好的产品信誉有可靠的保证。

严谨规范的生产技术原则
无公害农产品的环境品质独特性是其生产技术独特性所决定的，只有严谨规范的生产技术，才有符合特定标准的无公害农产品。无公害农产品是丰富多样的，具体到每种产品都应有与之相对应的产地、产品环境标准和生产全过程的操作规程配套。对无公害农产品生产影响甚大的外部环境如产地有无工业三废污染源和生产内部环境，如土壤重金属背景值过高，农药、化肥、除草剂等农资的环境负效在产品中的富积与残留，都必须按标准和规程要求予以科学严谨的把握，不能混同于一般的产品生产要求。

循序渐进的产品开发原则
农产品丰富多样，无公害农产品开发领域非常广泛，但并不是什么农产品都要开发成无公害农产品，也不是什么农产品都同时开发成无公害农产品，这要按市场规律循序渐进，不能一概而论。市场消费能力、消费观念、消费特点都是有阶段性，有不同档次和层次的要求，现阶段消费市场对无公害农产品正处于培育扩大过程，在生产中必须相适应地发展。由于技术进步的渐进性，有些农产品生产的无公害技术还受现实技术水平限制，难以达到无公害的质量标准，故此也决定了无公害农产品的渐进性。